Lo studio dei meccanismi molecolari attraverso i quali la componente edibile dell’ambiente interferisce con l’espressione dei geni è attualmente oggetto di numerosi studi sperimentali. Tuttavia, data la complessità del sistema, una reale comprensione, a livello molecolare, di tali meccanismi ad oggi non è ancora stata raggiunta. A tale riguardo, tra le metodologie in silico, la modellistica molecolare, il docking e le simulazioni di dinamica molecolare sono considerati strumenti molto potenti in grado di fornire informazioni dettagliate, su scala atomica e temporale, sul modo d’interazione fra molecole e sul comportamento strutturale e funzionale delle molecole stesse.
La tesi prevede uno screening delle interazioni fra molecole derivanti da alimenti funzionali e diversi target epigenetici mediante docking molecolare e dinamica molecolare simulata. I dati ottenuti verranno analizzati per valutare e/o predire l’effetto di un particolare alimento funzionale sul target epigenetico. Per validare le predizioni in silico potranno essere effettuati opportuni esperimenti in vitro su colture cellulari.
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