Studio di eventi di RNA editing con metodi bioinformatici massicciamente paralleli

L’RNA editing è uno dei processi post-trascrizionali ancora poco conosciuti, con il quale la cellula incrementa la diversità trascrittomica e proteomica In collaborazione con il centro di supercalcolo Cineca, è stato sviluppato HPC-REDItools, un tool bioinformatico per ricercare eventi di editing in maniera estremamente efficiente in paralello su decine/centinaia di campioni di RNAseq. Prerequisiti: conoscenza di tecniche di programmazione, shell scripting e python. La tesi si svolgerà in collaborazione con i colleghi della sede romana del Cineca (Via dei Tizii, zona Università Sapienza)

Contatti
gchillemi@unitus.it
Sede
Università degli Studi della Tuscia e Cineca

Developed by the CNBA-team C: prof. Andrea Cabibbo
N: Andrea Ninni
B: Francesca Brunetti
A: Romina Appierdo