Presso il Laboratorio di Bioinformatica Strutturale del Prof. Mattia Falconi, in collaborazione con il Liver Disease Lab (cicBIOGUNE, Bilbao), sono disponibili 2 posizioni per lo svolgimento della tesi di laurea magistrale.
I progetti riguarderanno lo studio computazionale dell’enzima Cistationina beta-sintasi (CBS), una proteina chiave nel metabolismo dello zolfo e coinvolta in gravi patologie metaboliche.
- Progetto 1: Studio del riorientamento conformazionale dei domini regolatori (Bateman modules) indotto dal legame con il regolatore allosterico SAM. L’obiettivo è simulare il riorientamento dei domini Bateman della CBS (osservati in strutture cristallografiche) per capire come l’enzima percepisca i nutrienti e ne attivi il metabolismo. La comprensione di tale meccanismo d’azione è fondamentale per mappare i difetti di attivazione allosterica nella patologia dell’Omocisteinuria classica.
- Progetto 2: Caratterizzazione strutturale di un filamento composto da un decamero di dimeri di CBS umana. Il progetto mira a confrontare la dinamica del sistema WT con quella del mutante R336C, variante legata allo sviluppo dell’Omocisteinuria classica. L’analisi delle simulazione chiarirà come la mutazione influenzi l’architettura, la flessibilità e la stabilità del filamento su larga scala.
Possono candidarsi studenti che abbiano superato l’esame di Bioinformatica Strutturale e con non più di 2/3 esami curriculari rimanenti.
Gli studenti interessati possono contattare il Prof. Mattia Falconi (falconi@uniroma2.it) o Davide Pietrafesa (davide.pietrafesa@uniroma2.it).